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在乌鲁木齐新市区，营业执照丢失后注销的步骤如下：
公示营业执照作废声明：企业应先在国家企业信用信息公示系统上公示 “营业执照作废声明”，以此作为注销的前提步骤，防止他人冒用。
登报声明：在当地指定的媒体上发布营业执照遗失公告，公示期限一般为 45 天。公告内容包括公司名称、统一社会信用代码、法定代表人姓名、营业执照号码等。
补领营业执照：准备法定代表人（或负责人）的身份证明、营业执照正副本丢失的书面说明、公司章程复印件（如有）等材料，到乌鲁木齐市新市区市场监督管理局领取并填写《营业执照遗失补领申请书》，提交材料后，等待审核，审核通过后领取新的营业执照。
税务注销：向税务机关申报清税，结清应纳税款、滞纳金和罚款，缴销发票和其他税务证件，获取清税证明。
办理营业执照注销：公告期满后，携带补领的营业执照正副本、法定代表人身份证、《营业执照遗失注销申请书》、清税证明、公示期满无异议的公告报纸等材料，到新市区市场监督管理局办理营业执照注销手续。
后续事项处理：包括前往社会保险经办机构办理社会保险登记的注销手续，以及到公安局指定的刻章点办理公司印章的注销手续等。
